В разделе «Компании» выбираем первую компанию, нажимаем меню «Действия» — «Соединить компании»:

Выбираем 2-ю компанию (вводим название, телефон, или ИНН в строку поиска):

Подтверждаем:

Контактные лица, адреса компаний, юридические лица объединяются.